David Alonso a décroché une nouvelle position position à Misano, l'emportant avec plus de 4 dixièmes d'avance sur ses adversaires. Le leader du championnat du monde Moto3 partira devant le rookie Luca Lunetta, excellent deuxième, et Ivan Ortola troisième.
La deuxième rangée sera ouverte par la Honda d'Angel Piqueras devant la Husqvarna (KTM) de Collin Veijer, tombé en fin de séance. L'Australien Joël Kelso s'élancera sixième. Douzième place pour le vainqueur du Grand Prix précédent en Aragon, José Antonio Rueda.
GP de Saint-Marin - Grille Moto3 :
1. David Alonso (CFMoto)
2. Luca Lunetta (Honda)
3. Ivan Ortola (KTM)
4. Angel Piqueras (Honda)
5. Collin Veijer (Husqvarna)
6. Joel Kelso (KTM)
7. Daniel Holgado (GasGas)
8. Adrian Fernandez (Honda)
9. Taiyo Furusato (Honda)
10. Stefano Nepa (KTM)
11. Filippo Farioli (Honda)
12. José Antonio Rueda (KTM)
13. Ryusei Yamanaka (KTM)
14. David Muñoz (KTM)
15. Riccardo Rossi (KTM)
16. Matteo Bertelle (Honda)
17. Jacob Roulstone (GasGas)
18. Vicente Perez (Honda)
– Q1 –
19. David Almansa (Honda)
20. Scott Ogden (Honda)
21. Nicola Carraro (KTM)
22. Xabi Zurutuza (KTM)
23. Tatsuki Suzuki (Husqvarna)
24. Joel Esteban (CFMoto)
25. Noah Dettwiler (KTM)
26. Tatchakorn Buasri (Honda)
27. Jakob Rosenthaler (Husqvarna)